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¿Qué es un contig bioinformatica?
Un contig es una contracción que proviene de la palabra inglesa contiguous que significa contiguo, es usado en bioinformática para describir una serie de secuencias superpuestas de ADN utilizadas para hacer un mapa físico que reconstruye la secuencia original de ADN de un cromosoma o de una región de un cromosoma.
¿Qué es un read en Secuenciacion?
Read: una secuencia obtenida del secuenciador. Overlap: región alineada de dos o más secuencias.
¿Qué significa Contigs?
Un cóntigo — de la palabra contiguo– es una serie de secuencias superpuestas de ADN utilizadas para hacer un mapa físico que reconstruye la secuencia original de ADN de un cromosoma o de una región de un cromosoma.
¿Cómo funciona la secuenciación de Sanger?
El método de Sanger se basa en sintetizar, de forma secuencial, una hebra de ADN complementaria a una hebra de cadena simple (que se utiliza como molde), en presencia de ADN polimerasa, los cuatro 2′-deoxinucleótidos que componen la secuencia del ADN (dATP, dGTP, dCTP y dTTP) y cuatro dideoxinucleótidos (ddATP, ddGTP.
¿Qué es la profundidad de secuenciación?
Lecturas o secuencia del ADN continua obtenida de un secuenciador. Es la cobertura o la parte estimada del genoma que ha sido secuenciada. Profundidad de cobertura es la media del número de veces que cada base de un genoma secuenciando tiene una read que alinea en esa posición.
¿Qué es un Conting en genetica?
¿Qué es el pipelining y para qué sirve?
El pipelining hace un uso más eficiente de los recursos disponibles del CPU poniendo todas sus unidades a trabajar simultáneamente, permitiéndole de esta forma realizar más trabajo total por cada nanosegundo. Con esta última explicación concluye la primera parte de nuestra guía… manténganse alerta para la publicación de la segunda parte
¿Cuál es el tiempo de ejecución del pipelining?
Observa que el pipelining no cambia el tiempo total de ejecución para cada instrucción individual. Cada instrucción se toma aún 4ns para abrirse camino en el procesador; esos 4ns pueden ser divididos en 4 ciclos e 1ns cada uno o en 1 solo gran ciclo, pero son los mismos 4ns.
¿Cuál es el ritmo de ejecución de un pipeline?
Pero una vez que comience el cuarto ciclo, la primera instrucción entrará en la etapa de escritura y el pipeline podrá comenzar a ejecutar nuevas instrucciones en cada ciclo, las cuales tendrán un ritmo de ejecución de 1 instrucción/ns, pues cada ciclo tiene un nanosegundo de longitud. Encogiendo el tiempo de ejecución de programa.
¿Qué es la bioinformática?
La bioinformática, según el National Human Genome Research Institute (NHGRI), es una subdisciplina de la biología y de la informática que se ocupa de la adquisición, el almacenamiento, el análisis y la difusión de datos biológicos, en su mayoría secuencias de ADN y aminoácidos.